Негізгі айырмашылық - нуклеотидтерді жоюға қарсы жөндеудің базалық экспрессиясы
ДНҚ әр түрлі ішкі және сыртқы факторлардың әсерінен жиі зақымдалады. Алайда, ұялы жөндеу жүйелері зақымдануды мутацияға айналғанға дейін немесе кейінгі ұрпаққа берілместен дереу және үнемі түзетеді. Жасушаларда кесуді жөндейтін жүйенің үш түрі бар: нуклеотидті кесуді жөндеу (НЭР), базалық кесуді жөндеу (БЭР) және ДНҚ -ның сәйкес келмеуін жөндеу (ДНҚ ), бір тізбекті ДНҚ зақымдарын жою. Нуклеотидті эксцизионды жөндеуден негізгі айырмашылық мынада: базальды экзирлеу - бұл жасушаларда жұмыс жасайтын, нуклеотидтердің эндогенді зақымдануын түзететін қарапайым жүйе, ал нуклеотидті кесуді жөндеу - жасушаларда салыстырмалы түрде жөндеуге арналған күрделі жөндеу жүйесі. экзогенді әсерінен үлкен, зақымдалған аймақтар.
МАЗМҰНЫ
1. Шолу және негізгі айырмашылық
2. Базалық кесуді жөндеу дегеніміз не
3. Нуклеотидті экзизионды жөндеу дегеніміз не
4. Жанама салыстыру - Нуклеотидті экзизионды жөндеуге қарсы базалық экзекция
5. Қорытынды
Базалық кесуді жөндеу дегеніміз не?
Базалық кесуді жөндеу - бұл жасушалардағы ДНҚ жөндеу жүйесінің ең қарапайым нұсқасы. Ол ДНҚ -дағы кішігірім зақымдарды жою үшін қолданылады. ДНҚ негіздері дезаминдену немесе алкилденуге байланысты өзгертіледі. Базалық зақымданулар болған кезде, ДНҚ гликозилазасы базалық экзекцияны қалпына келтіру жүйесін таниды және белсендіреді, оны AP эндонуклеаза , ДНҚ полимераза және ДНҚ лигазасы ферменттерінің көмегімен қалпына келтіреді. BER жүйесінде келесі қадамдар қолданылады.
- ДНҚ гликозилазасының дұрыс емес немесе зақымдалған негізді тануы және жойылуы, абазиялық учаске құру үшін (базисті жоғалтатын жерлер - апиуриндік немесе апиримидиндік учаскелер).
- Апуриндік/апиримидиндік эндонуклеазаның көмегімен абазиялық жерді кесу
- Қалған қант фрагментін лиаз немесе фосфодиэстеразаның көмегімен жою
- ДНҚ -полимеразамен саңылауды толтыру
- Никті ДНҚ лигазасымен тығыздау
01 -сурет: Базаны кесуді жөндеу жолы
Нуклеотидті экзекцияны жөндеу дегеніміз не?
Нуклеотидті кесуді жөндеу (NER) - жасушаларда ДНҚ -ны жоюдың маңызды жүйесі. Бұл жөндеу қабілетті болып табылады және ұзындығы 30 базаларға зақымдалған өңірлерді дейін ауыстыру және ол бүлінбеген арқылы бағытталған үлгісі бұрымға . ДНҚ -ның жалпы зақымдануы ультракүлгін сәулеленудің әсерінен пайда болады, ал NER ДНҚ -ны мутацияға дейін және болашақ ұрпаққа өтпес бұрын немесе ауруды тудырар алдында осы зақымдарды қалпына келтіру арқылы қорғайды. NER экологиялық факторлар мен химиялық канцерогендер сияқты жанама әсер ететін мутациялардан қорғауды қамтамасыз етеді. NER барлық дерлік организмдерде кездеседі және ДНҚ спиралында айтарлықтай бұрмалануға әкелетін зақымдарды таниды.
NER процесі XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB және т.б сияқты көптеген ақуыздардың әсерін қамтиды және кесу мен қоюға ұқсас бірнеше механизмдер арқылы жүреді. Бұл ақуыздар қалпына келтіру процесінің аяқталуы үшін өте қажет және NER ақуыздарының біріндегі ақау өте маңызды және сирек рецессивті синдромдарды тудыруы мүмкін: ксеродерма пигментозы (XP), Кокейн синдромы (CS) және шаштың сынғыштығының фотосезімтал түрі трихотиодистрофия (TTD).
02 -сурет: Нуклеотидтерді жою
Базалық кесуді жөндеу мен нуклеотидті кесуді жөндеудің айырмашылығы неде?
Нуклеотидтерді жоюға қарсы базалық кесуді жөндеу | |
| Базалық кесуді жөндеу (BER) - бұл жасушаларда болатын ДНҚ түзету жүйесі. | Нуклеотидті кесуді жөндеу (NER) - жасушаларда кездесетін ДНҚ жөндеу жүйесінің тағы бір түрі. |
| ДНҚ аддуктивтерін тану | |
| BER кіші ДНҚ аддуктыларының зақымдалуын түзейді. | NER үлкен ДНҚ аддукттарын жөндейді. |
| ДНҚ зақымдануы | |
| BER ДНҚ спиральына елеулі бұрмаланулар әкелмейтін зиянды мойындайды. | NER ДНҚ спиралына айтарлықтай бұрмаланулар әкелетін зақымдарды таниды. |
| ДНҚ зақымдануының себептері | |
| BER эндогендік мутагендер келтіретін зақымдарды жөндейді. | NER экзогендік мутагендер келтірген зиянды жөндейді. |
| Күрделілік | |
| BER - жөндеудің ең күрделі жүйесі | Бұл BER -ге қарағанда күрделі. |
| Ақуызға қажеттілік | |
| BER басқа ақуыздарды қажет етпейді. | NER зақымдалған және зақымдалмаған аймақтарды ажырату үшін бірнеше гендік өнімдерді, әсіресе ақуыздарды қажет етеді. |
| Жарамдылық | |
| BER бір негізді зақымдарды жоюға жарамды. | NER зақымдалған аймақтарды ауыстыруға жарамды. |
Қысқаша мазмұны - Нуклеотидтерді жоюға қарсы базалық экспозиция жөндеу
NER және BER - жасушаларда кездесетін ДНҚ -ны жою процесінің екі түрі. BER эндогенді түрде келтірілген кішігірім зақымдарды жөндей алады, ал NER 30 экзогендік зақымданған негізгі базалық жұпқа дейінгі зақымдалған аймақтарды жөндей алады. BER NER -ден субстраттардың түрлерінде және бастапқы бөліну жағдайында ерекшеленеді. BER сонымен қатар ДНҚ спиральының елеулі бұрмалануынан туындамаған зақымдарды тани алады, ал NER ДНҚ спиралінің елеулі бұрмалануын таниды. Бұл базалық экзекция мен нуклеотидті экзекция арасындағы айырмашылық.
Суреттің рұқсаты:
1. «Dna жөндеу базасы экскурсиясы» LadyofHats - (Public Domain) Commons Wikimedia арқылы
2. «Увр ақуыздарымен реттелетін нуклеотидтерді жою жолдарының модельдерінің схемасы» Рихито Морита, Шухей Накане, Атсухиро Шимада, Масао Иноуэ, Хитоши Иино, Тайсуке Вакамацу, Кенджи Фукуи, Норико Накагава, Рёдзи Масуи және Сейки Курамицу - (CC BY 1.0) Commons Wikimedia арқылы
Әдебиеттер:
1. Ким, Юн-Чжон және Дэвид М.Уилсон. «Базалық экзизионды жөндеу биохимиясына шолу». Қазіргі молекулалық фармакология. АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы, 2012 ж. Қаңтар. 14 наурыз 2017 ж.
2. Бур, Ян Де және Ян Хидж Хойеймакерлер. «Нуклеотидтерді жою және адам синдромдарын жөндеу» Канцерогенез. Оксфорд университетінің баспасөзі, 01 наурыз 2000 ж. Веб. 28 наурыз 2017 ж
3. Hoogstraten және т.б. «Дүниежүзілік генетикалық нуклеотидтік экспекция протеині XPC арқылы ДНҚ зақымдалуын анықтау». Жасушалық ғылымдар журналы. Company of Biologists Ltd, 01 қыркүйек, 2008. Интернет. 28 наурыз 2017 ж
